游戏故事叙述在某个满月之夜第三新东京市遭到神秘的空袭，不过奇怪的是 NERV 并未发布出击命令，来袭的可能是使徒以外的敌人？ 在空袭后的隔日，真嗣的班上加入了一名美少女转学生雾岛真名，她对真嗣展开了积极的接触。 这部游戏中增添了新的原创角色 “雾岛真名”，随着剧情的发展，她将会和真嗣产生怎样的感情？ 还有面对明日香的吃醋，真嗣又应该如何应对？ 一切就等你自己在游戏中亲自发掘了！