Metal Gear Solid Peace Walker

故事设定在公元1974年，《合金装备:掌上行动》剧情的四年后，《合金装备V:原爆点》的一年前。
正当冷战接近尾声，美苏两国签订战略武器限制谈判时，被称为“美国后院”的中美洲国家哥斯达黎加遭到不明外来军队入侵。
由于哥斯达黎加在和平宪法的限制下，无法拥有自己的军队，且外来军队入侵的目的不明，于是，哥斯达黎加和平大学的女学生帕兹和教授盖尔维玆委托“无国界士兵”的首领斯内克调查外来军队入侵的真相。
而在会面的过程中，斯内克从盖尔维玆提供的录音带里，得知自己的恩师The Boss可能存活在世界的某个地方而感到十分意外，因而接受了委托。
然而在调查的过程中，斯内克不但步步将自己和“无国界士兵”推入险境。
同时，他也将揭开自己的恩师The Boss不为人知的过去。