本作的世界是由记录“高达”世界历史的名为“世界核心”的核心系统及管理世界核心，守护其不为外敌侵犯的名为“世纪系统”的系统形成。
世纪系统平时被称为“地球外衣”的拟态存在所隐盖，系统内部有着被称作“管理者”的存在守护世界核心不被外敌侵入，维持世界的秩序。
不知何人使得世界核心暴走，在一片混乱中，新的故事拉开了帷幕。