在交易都市的郊区做着药店生意的少女、『阿尼艾丝・拉巴丽埃』。
自幼失去双亲的阿尼艾丝、在曾经是炼金术师的祖母家与妹妹露法一起过着朴实的生活――但是妹妹得了1天大部分时间都会睡着叫做『睡美人』的怪病这让她非常担心。
某一天、在阿尼艾丝前去采集的森林的小路上、与身为炼金术师的老师、柏鲁・法里斯时隔7年再次相遇。
被追着还债的柏鲁、利用了阿尼艾丝那作为炼金术师的才能与美丽的容貌、还有容易受骗的性格、启蒙她能治好妹妹病的炼金术、作为交换偷偷的让阿尼艾丝完成秘密的委托、以便能还清自己欠的债。
另一方面、阿尼艾丝自己也作为冒险者四处奔走收集炼金术的材料、之后遭受了各种各样的事情。